Çalıkuşu romanının olayları, İstanbul, B. (Bursa), Zeyniler Köyü, Ç. (Çanakkale), İzmir, Kuşadası, Tekirdağ’da geçmektedir.

Fiziksel anlamda ana karakter Feride’nin yaşadığı bu mekânlar içinde ayrıca yer alan özel mekânlar da bulunmaktadır. Örneğin Feride’nin İstanbul’daki mektebi Dame de Sion, teyzesinin konağı, B.’deki otel, Zeyniler’deki ev ve mektep, Ç.deki ve İzmir’deki mektepler, Dr. Hayrullah’ın çiftlik evi, Tekirdağ’daki Besime teyzesinin evi vb.

Çalıkuşu romanının baş kişisi için İstanbul’daki en önemli fiziksel mekân mekteptir. Fakat asıl önemli olan romanın vakasının geçtiği dönemlerde atıl durumda görülen Anadolu’dur. Anadolu, İstanbul’dan zorunlu olarak gidilen bir sürgün yeri gibi görülmektedir. Bu nedenle Feride’nin Anadolu’ya öğretmen olarak gitmek istemesi Maarif Vekâletinde garipsenmiştir. Feride ile birlikte Anadolu’nun içinde bulunduğu sosyal durum derinlemesine olmamakla beraber gözler önüne serilir.