Elektron mikroskobunun ve ileri görüntüleme teknolojilerinin kullanılmaya başlanmasının hücre teorisine büyük katkılar sağlamıştır. Elektron mikroskobu, elektron demetlerini görüntüleme sağlamak için kullanan ve ışık mikroskobu ile görüntülenemeyen daha küçük objelerin imgelenmesine imkân veren bir mikroskoptur. Virüslerin de dahil olduğu pek çok yapı veya mikroorganizmanın incelenmesine olanak sağlar. Elektronların yaydıkları ışınlarla bir objeyi bir milyon defa büyütebilmektedir. Elektromanyetik çubuklar mercekler yerine kullanılır, böylece 1 µm ve 10A büyüklüğünde cisimler ayırt edilebilir.