Çıplak gözle görülemeyen ancak mikroskop yardımıyla görülebilen canlılara mikroskobik canlılar denir. Mikroskobik canlılar; suda, havada, toprakta ve diğer canlıların vücutlarında yaşayabilen canlılardır. Mikroskobik canlılar gelişmişlik özelliklerine  göre bakteri ve protozoa olarak incelenirler.

BAKTERİ
Mikroskobik canlıların en basit yapılı olanlarına bakteri denir.
Bakteriler birçok yerde yaşayabilirler. En çok da atıkların bulunduğu yerlerde ve sularda yaşarlar.
Bakteriler çok soğuk ve çok sıcak ortamlarda yaşarlar.
Bakterilerin faydalı olanları ve zararlı olanları vardır.
Örneğin sütten yoğurt elde edilmesinde yararlanılan bakteriler faydalı iken, hastalıklara yol açan bakteriler zararlıdır. 
Verem, zatürre, kolera gibi hastalıklara bakteriler neden olur.

PROTOZOA
Bakterilere göre daha gelişmiş olan ve mikroskobik canlılara protozoa denir.
Örneğin: Öglena, amip, terliksi hayvan, sıtma mikrobu Protozoaların bir kısmı canlıalrın vücudunda bir kısmı da deniz ve tatlı sularda yaşarlar.