Hidroelektrik santralleri birçok avantajı beraberinde getirse de, bazı dezavantajları da vardır. Bunlar şunlardır:

1. Çevre kirliliği: Hidroelektrik santralleri, su kaynaklarındaki debi değişiklikleri nedeniyle suya bağımlıdır. Bu da suyun yeterli olmadığı zamanlarda santralin verimliliğini azaltır ve su kaynaklarının kullanımında çevre kirliliğine neden olabilir.

2. Habitat kaybı: Hidroelektrik santralleri için barajlar inşa edilmesi gerektiği için, barajlar inşa edilen alanlarda yaşayan bitki ve hayvanların yaşam alanları ortadan kalkar. Bu da ekosistemi etkiler ve bazı türlerin nesillerinin tehlikeye girmesine neden olabilir.

3. Su kirliliği: Hidroelektrik santrallerinde baraj gölü gibi su birikintilerinde, su kirliliği oluşabilir. Baraj gölü gibi su birikintilerindeki suların doluluk oranına göre yüzeyinde algler ve su yosunları gibi bitkiler çoğalabilir ve suyun kalitesinde azalmaya neden olabilir.

4. İklim değişikliği: Hidroelektrik santrallerinin yapımı, arazi kullanımını değiştirerek iklim değişikliğine yol açabilir. Özellikle baraj inşaatı ve su birikintilerinin etrafındaki ormanların yok edilmesi, karbondioksit emilimini azaltır ve iklim değişikliğiyle ilgili sorunları arttırır.

5. Yüksek yatırım maliyetleri: Hidroelektrik santralleri, yapımı için yüksek yatırım maliyetleri gerektirir. Bu nedenle, hidroelektrik santrallerinin inşa edilmesi, ekonomik açıdan uygun olmayabilir ve finansal riskler taşıyabilir.

Hidroelektrik santralleri, elektrik üretmek için su gücünden yararlanır ve düşük karbon salımı nedeniyle yenilenebilir enerji kaynakları arasında önemli bir yere sahiptir. Ancak, hidroelektrik santrallerinin bazı dezavantajları da vardır. Bunlar şunlardır:

1. Ekosistemlere zarar verir: Hidroelektrik santralleri, suyun akışını değiştirerek çevresel etkilere neden olabilir. Barajların yapımı, bitki örtüsünün yok olmasına, balık ve diğer su canlılarının yaşam alanlarının bozulmasına, nadir türlerin yok olmasına ve yerel ekosistemlerin bozulmasına neden olabilir.

2. Göçmen balık türlerinin engellenmesi: Hidroelektrik barajlarının yapımı, bazı balık türlerinin göç rotalarını engelleyebilir. Barajlara tırmanmaya çalışan balıklar, genellikle balık merdiveni olarak adlandırılan yapılarla yönlendirilmeye çalışılır. Ancak bu tür yapılar bazen yeterli olmayabilir ve göçmen balık türlerinin neslinin tükenmesine yol açabilir.

3. Toprak erozyonu: Barajların yapımı, etrafındaki toprakların erozyonuna neden olabilir. Ayrıca, barajlardan salınan sular, aşırı sel ve taşkın risklerini artırabilir.

4. Sosyal etkiler: Hidroelektrik santrallerinin yapımı, bazı insanların yaşam alanlarını ve topraklarını kaybetmelerine neden olabilir. Ayrıca, yerel topluluklar da dahil olmak üzere birçok insan, barajların yapımı ve suların yönetimi ile ilgili olarak konsültasyon süreçlerinde yeterince temsil edilmeyebilir.

5. Yatırım maliyetleri: Hidroelektrik santrallerinin yapımı, büyük yatırım maliyetleri gerektirir. Bu nedenle, bazı ülkelerde hidroelektrik santrallerin yapımı, diğer enerji kaynaklarına göre daha az çekici hale gelebilir.