Maddenin yapı taşı, atomdur. Atomu görüntülemek için özel görüntüleme sistemleri kullanılmaktadır. Her mikroskopla atomların görüntülenmesi mümkün değildir. Elektron mikroskoplarıyla yapılan görüntülemeler atomun görüntülenmesini sağlar. Sıradan ışık mikroskoplarıyla atomun gözlemlenebilmesi mümkün değildir. Bu nedenle atomları görmek için özel mikroskoplara ihtiyaç vardır.

Maddenin yapı taşları mikroskopla görülebilir. Fakat bunun için özel tasarlanmış mikroskoplara ihtiyaç vardır. Elektron mikroskopları bu işe yaramaktadır. Atom katmanlardan oluşmaktadır. Çekirdek, nötron ve protonlardan meydana gelir.  Çekirdek etrafında da elektron katmanları bulunmaktadır. Elektronlar bulutsu bir yapıda katmanlarda bulunmaktadır. Elektronlar hareket halindedir. Çekirdek unsurları ise hareket etmez. Mikroskobik olarak gözlem için özel mikroskop gerekir.