Simya ile Kimya arasında bazı temel farklılıklar bulunur. Bu farklılıklar şunlardır:

• Simya bir bilim dalı değildir, Kimya bilim dalıdır.
• Simya deneme-yanılmaya dayalı çalışmalar içerir, Kimya belirli yöntemler kullanılarak sistematik ve bilimsel çalışmalar yapar.
• Simya’da çalışmalar teorik bir temele dayanmaz. Kimya çalışmaları deneyseldir.
• Simya’da sistematik bilgi birikimi oluşmamıştır. Kimya’da sistematik bilgi birikimi oluşmuştur.
• Simya modern kimyanın başlangıcı ve öncüsüdür. Simyacıların keşifleri daha sonra kimyacılar tarafından kullanıldı.
• Simya deneylere ve deneyimlere bağlıydı ve bilimde çok bir temeli yoktu. Kimya hem deney hem bilime dayanır.
• Modern kimya bilimsel teorilere ve deney sonuçlarına dayanır. Simya ise mit, din, astroloji, sihir, felsefe ve ruhçuluğun karışımıdır.
• Modern kimyanın çok fazla pratik uygulaması vardır, simya dönemi ise modern kimyanın başlangıcı sayılır.