1. Murad'ın getirdiği bu değişiklik ile taht kavgaları azalmış fakat sona ermemiştir. Zira  padişah öldüğünde tahta kimin geçeceği hala net olarak belli değildir. Bu nedenle veraset sisteminde tekrar değişikliğe gidilmiştir.

 

Fatih Sultan Mehmet tahta geçtiğinde veraset sisteminde ikinci değişikliği yapmıştır. Aslında bu bir değişiklik değil, veraset sistemine yapılan bir genişletmedir. Bu değişiklik ile padişah olan kardeşin diğer kardeşlerini öldürülmesine izin verilmiş yani kardeş katli yasallaştırılmıştır. Fatih Sultan Mehmet bunu şöyle açıklamıştır; devletin bekası ve nizam-ı alem için kardeş katli vaciptir. Böylece Osmanlı Devleti'nde kardeş katli dönemi başlamıştır. Fatih'in bu uygulaması veraset sistemini düzenli hale getirmediği gibi, tahta çıkma kavgaları da artmış ve vahşileşmiştir.

 

Veraset sisteminde yapılan değişikliklerden bir diğeri ise 1. Ahmet tarafından yapılmıştır. Bu değişiklik ile eski uygulamanın yerini ekber ve erşat sistemi almıştır. Buna göre; devletin başına gelecek ve padişah olacak kişi hanedanın en büyük ve aklı başında olan üyesidir. Bu uygulamanın ortaya çıkmasının nedeni kardeş katlini önleyebilmektir. Fakat bu uygulamanın ise Osmanlı Devleti'ne hatırı sayılır oranda olumsuz etkisi olmuştur. Bu uygulama ile birlikte şehzadelerin sancağa çıkması yasaklanmış ve kafes usulü benimsenmiştir. Bu da deneyimsiz şehzadelerin tahta çıkmasına yol açmıştır.